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翻译组测序在基因表达调控和新型功能多肽研究中的应用
2023-12-05 20:00课程 人已围观
报告内容简介
报告1:
转录-翻译-蛋白多组学关联分析茶树芽叶次生代谢调控规律
报告内容:
茶树幼芽次生代谢产物,尤其是类黄酮类物质的积累受到生长发育的调控。采用转录组、翻译组和蛋白质组学等方法,揭示茶叶芽叶发育过程中次生代谢的调控机制,可以为茶树生物学提供相关的背景数据,也为非模式植物的研究方法提供新的思路。
(1)翻译组学简介
(2)非模式植物的多组学联合分析
(3)多组学联系分析的数据挖掘——以茶树芽叶为例
报告2:circCDH1文章第一作者
环状RNA编码蛋白在胶质瘤进程中作用的机制研究
报告内容:
环状RNA在胶质瘤进程中发挥重要作用。随着测序技术的不断进步,传统意义上非编码的环状RNA被证实可以翻译蛋白并发挥独特作用。因环状RNA特异性接口结构的存在,使得其编码的蛋白为完全不同于母基因的全新蛋白。纵观整个环状RNA翻译研究现状,此领域尚待进一步开发。无论是阐释胶质瘤具体发生发展机制还是寻找潜在治疗靶标。该领域都将成为未来最具前景的方向之一。
提纲:
1. 环状RNA的简介以及鉴定要点
2. 环状RNA可翻译潜能预测以及主要鉴定办法
3. Circular RNA-encoded oncogenic E-cadherin variant promotes glioblastoma tumorigenicity through activation of EGFR–STAT3 signalling
报告3:
5′UTR 区的uORF翻译——一个依然被人忽视的金矿
内容简介:
5′UTR在翻译调控中至关重要,近半数转录本的翻译受到5′UTR区小开放阅读框(uORF)调控。但无论从研究论文的数量和深度看,这个领域的研究价值还远远没有被充分挖掘。人们通常认为, uORFs通过影响起始核糖体的移动,从而抑制或者激活主开放阅读框(mORF)的翻译。但越来越多研究表明,uORF编码的多肽可以独立于下游的mORF,行使不同的生物学功能,从而大大丰富了细胞蛋白质多样性。无论是功能多肽挖掘还是治疗靶点开发,uORF的研究才刚刚开始,这是一个令人兴奋的前沿领域。
报告主要内容:
(1)简要概述ribo-seq的应用,以及该技术对新型多肽挖掘的价值
(2) uORF在生物体内的翻译特征以及功能调控机制
(3) 以PTEN uORF编码的多肽MP31研究为例[3],讲解uORF编码多肽的研究思路