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python中PCA的处理过程
2023-12-13 23:19课程教程文章 人已围观
1、输入矩阵归一化处理。
2、计算样本协方差矩阵。
3、求解协方差矩阵指定的特征值对应特征向量。
4、确定转换矩阵,求解降维数据。
实例
#/usr/nom/envpython #_*_coding:utf-8_*_ #@Time:2021/9/310:04 #@Author:Abigfish #@FileName:maindemo13.py #@Software:PyCharm importmatplotlib.pyplotasplt importnumpyasnp frompylabimport* #首先导入数据,此部分为从存储列表或单元中读取分析数据 defloadDataSet(filename,delim='\t'):#此处的'\t'表示不同变量间的分隔符,t表示tab键键入的空格 fr=open(filename) stringArr=[line.strip().split(delim)forlineinfr.readlines()] dataArr=[list(map(float,line))forlineinstringArr] returnnp.mat(dataArr) #定义pca分析函数 defpca(dataset,topNfeat=99999):#topNfeat特征值数目,通常不用设置,因为后续要进行可视化分析 meanVals=np.mean(dataset,axis=0)#求均值 meanRemoved=dataset-meanVals#预处理 covMat=np.cov(meanRemoved,rowvar=0)#求解输入数据协方差矩阵 eigVals,eigVects=np.linalg.eig(np.mat(covMat))#求解特征值,特征向量 eigVaInd=np.argsort(eigVals)#对特征值进行排序处理,默认为升序 eigVaInd=eigVaInd[-1:-(topNfeat):-1]#根据指定数目进行逆序处理 redEigVects=eigVects[:,eigVaInd]#选取对应特征向量 lowDataMat=meanRemoved*redEigVects#数据降维X*P recontMat=(lowDataMat*redEigVects.T)+meanVals#c处理进行了数据重构,非必须选项 returnlowDataMat,recontMat,eigVals#返回数据 #定义特值值绘制函数 defplotEig(dataset,numFeat=20): mpl.rcParams['font.sans-serif']=['TimesNewRoman'] sumData=np.zeros((1,numFeat)) dataset=dataset/sum(dataset) foriinrange(numFeat): sumData[0,i]=sum(dataset[0:i]) X=np.linspace(1,numFeat,numFeat) fig=plt.figure() ax=fig.add_subplot(211) ax.plot(X,(sumData*100).T,'r-+') mpl.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] plt.ylabel('累计方差百分比') ax2=fig.add_subplot(212) ax2.plot(X.T,(dataset[0:numFeat].T)*100,'b-*') plt.xlabel('主成分数') plt.ylabel('方差百分比') plt.show() #定义原始数据及第一主成分绘制函数 defplotData(OrigData,recData): importmatplotlib.pyplotasplt fig=plt.figure() ax=fig.add_subplot(111) ax.scatter(OrigData[:,0].flatten().A[0],OrigData[:,1].flatten().A[0],c='blue',marker='^',s=90) ax.scatter(recData[:,0].flatten().A[0],recData[:,1].flatten().A[0],c='red',marker='o',s=90) plt.show()
以上就是python中PCA的处理过程,希望对大家有所帮助。更多Python学习指路:python基础教程
本文教程操作环境:windows7系统、Python 3.9.1,DELL G3电脑。
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