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微生物群落三代全长16s扩增子测序分析

2023-12-05 20:00课程 人已围观

微生物群落三代全长16s扩增子测序分析

伴随三代测序技术的推广,其在微生物领域的研究越来越广泛。16s rDNA总长约1500bp,有9个可变区,类似于微生物的指纹,可用于鉴别微生物。过去二代测序受限于测序读长,仅能从9个可变区中挑选1-2区域进行测序分析,在属、种等精细水平分辨率差强人意。三代测序具有超长的读长,能够将16s rDNA所有可变区进行全区域测序,实现高精度微生物群落分析,为菌株级别分析、筛选提供了坚实条件。

本系列课程围绕三代全长16s扩增子的基础概念、技术原理、研究思路、前沿文献应用等多方面开展讲解,助力微生物高分文章产出。

本系列课程根据需求不定时更新,主要内容如下:

基于三代全长16S的微生物多样性分析(农学篇):介绍三代全长16s测序原理、技术特点,下机数据分析流程及各分析点的图形解读等内容,并结合具体文章案例介绍农学样本中三代全长16s技术的应用。

三代16s多组学关联分析思路应用:介绍微生物群落多组学研究的意义、研究方案以及当前三代16s与宏基因组、代谢组等多组学技术关联文章解读。

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