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细胞器基因组:叶绿体基因组边界图绘制

2023-12-05 20:00课程 人已围观

叶绿体基因组——边界收缩扩张图绘制

四分体结构的叶绿体基因组经常会和近缘物种比较边界位置情况。尽管已有软件和相关教程,但是仍存在一些难以发现的问题。如生成的图片不美观、重复区鉴定出错等等。

该课程详细的介绍了如何使用自编脚本进行边界图的绘制,并详细介绍了如何正确的鉴定重复区,以及如何调整genbank文件序列起点等。

通过本次学习,你将掌握叶绿体基因组边界图的绘制过程,掌握如何鉴定叶绿体的重复区,了解如何简单调整序列的起点。

课程大纲

1 对边界图绘制的简介
2 如何使用绘图脚本
3 如何确定叶绿体基因组边界
4 如何调整序列起点——perl脚本从头撰写
5 绘图脚本实现的原理介绍

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