circRNA翻译研究专题

课程大纲

一、circRNA如何被翻译的？
1.  RNA翻译机制概述
2.  不依赖5’-帽子的翻译机制
3.  circRNA的翻译起始
4.  circRNA的ORF

二、翻译组学在circRNA翻译研究中的应用
1.  翻译组学概述
2.  常见翻译组学技术概述
3.  翻译组学用于circRNA翻译研究4.  常见翻译组学数据库简介

三、核糖体测序技术流程与注意事项
1. 核糖体测序技术简介（Ribo-seq  or RNC-seq？）
2. Ribo-seq实验核心步骤解析
3. Ribo-seq实验数据质控分析

四、RIbo-sep 解密翻译之生信分析
1. Ribo-seq生信基础分析
2. 常用工具及数据库
3 .非编码RNA的编码潜能

五、如何验证circRNA的翻译？（基础篇）
1. circRNADb数据库的使用
2. ORF和序列分析
3. 载体构建与初步验证

六、如何验证circRNA的翻译？（提高篇）
1. circRNA翻译蛋白质（多肽）的检测与验证
2. 翻译起始及其机制的验证
3. 翻译过程的调控与验证

七、如何验证circRNA的翻译？（检测抗体篇）
1. 自制抗体的要求与注意事项
2. 如何查找适用的商业化抗体
3. 用抗体去发现可翻译的circRNA

八、circRNA翻译产物功能研究思路
1. circRNA翻译产物与母基因的关系
2. 新多肽的序列预测分析 
3. 新多肽的定位与互作分子分析 
4. 新多肽的功能研究思路

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