生物信息学入门课程：R语言与Bioconductor入门

个人简介
大家好，我是孟浩巍。很高兴能够在腾讯课堂与大家见面！


我目前就读与北京大学生命科学学院，正在攻读博士学位，在5年学习生物信息学分析的过程中积累了大量经验，很愿意分享给大家。
之前在某乎平台，我创建了一系列在线课程，先后有6000人参与并获得全部好评。

此外，我还创建了名为【生信坑】的生物信息学问答网站，欢迎大家有问题到网站上进行交流！我们在【生信坑】也会每周推送生信领域最信，最热的文章，并进行简要导读。网址：www.bioinfo.info


课程介绍
根据生物信息学数据分析的实战经验，我们推荐大家首先学习R语言及其相关的操作，这样能够最快地让大家把很多生物信息学数据可视化，并得出一定的统计学分析结论，而这些结论往往可以帮助我们进一步理解生物学问题。

那么我们本次课程主要是针对生物信息学进行一次更加深入地学习，主要是介绍R与Bioconductor的相关内容。

Bioconductor可以简单理解为基于R语言专门做生物信息学分析的众多工具包的集合，通过使用Bioconductor你可以快速地查找公共数据与公共资源；快速地对芯片数据，高通量数据进行分析与可视化；快速地进行若干生物信息学相关的各种分析。

总之，你如果想学习如何做生物信息学却不知道或者不会使用R与Bioconductor，那你就错过了一个事半功倍的利器！

课程主要内容
1. R语言与Bioconductor的背景介绍
2. Bioconductor网站浏览
3. Bioconductor的安装与源的选择
4. R语言基础语法的简单回顾
5. Bioconductor最常用的包
    - AnnotationHub
    - GenomicRange
    - BSgenome
    - Biostrings
    - GenomicFetures
    - rtracklayer
    - Gviz
6. ChIP-Seq的数据分析
    - 提取基因组序列信息
    - 转换 gene id
    - 计算genome 的 intron与exon长度
    - 可视化基因结构

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