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植物基因组数据库Phytozome

2023-12-05 20:00课程 人已围观

课程简介:
在生物信息分析中,我们经常需要用到基因组相关信息或文件。
那么,你知道一个完整的基因组文件包括哪些吗?
你知道经常提到的gff3注释文件具体有哪些内容吗?
如何从基因组序列中批量提取某个基因家族的蛋白序列呢?
如何从基因组中检索到我研究基因的相关注释信息呢?
如何从基因组序列中提取我研究基因的启动子序列呢?
如何从基因组中检索我研究基因的同源基因呢?
如何检测我设计引物在基因组上有多少结合位点呢?
本课程介绍基因组文件组成和内容、批量提取基因序列、单个基因检索、启动子序列提取、BLAST检索同源基因、BLAST检测引物特异性。



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