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零代码TCGA数据差异表达分析
2023-12-05 20:00课程 人已围观
本课程使用R的shiny工具，零代码做TCGA数据差异表达分析，
输入文件为合并好的表达谱矩阵。
如果没有准备好表达谱矩阵，请先学习《TCGA数据库简介及数据下载与表达谱合并》，或者直接学习系列课程《TCGA数据库介绍及数据挖掘》，该系列课程包括《TCGA数据库简介及数据下载与表达谱合并》，《零代码TCGA数据差异表达分析》和《R代码TCGA数据差异表达分析》三部分内容。
1.第一期，TCGA表达谱数据和样本类型文件准备。介绍DEApp工具。
2.第二期，讲解如何在DEApp工具中进行数据上传，表达谱归一化，PCA分析，基因过滤，差异表达分析，火山图，结果下载。
3.第三期，讲解DEApp中三种做差异表达分析的方法，limma，edgeR和DEseq2，结果比较。以及miRNA数据差异表达分析。
课程中使用的R环境和DEApp工具，用电脑打开腾讯课堂，在课程介绍的下方。
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1.第一期，TCGA表达谱数据和样本类型文件准备。介绍DEApp工具。
2.第二期，讲解如何在DEApp工具中进行数据上传，表达谱归一化，PCA分析，基因过滤，差异表达分析，火山图，结果下载。
3.第三期，讲解DEApp中三种做差异表达分析的方法，limma，edgeR和DEseq2，结果比较。以及miRNA数据差异表达分析。
课程中使用的R环境和DEApp工具，用电脑打开腾讯课堂，在课程介绍的下方。
