R代码TCGA数据差异表达分析

使用R代码做TCGA数据差异表达分析，  输入文件为合并好的表达谱矩阵。
如果没有准备好表达谱矩阵，请先学习《TCGA数据库简介及数据下载与表达谱合并》，或者直接学习系列课程《TCGA数据库介绍及数据挖掘》，该系列课程包括《TCGA数据库简介及数据下载与表达谱合并》，《零代码TCGA数据差异表达分析》和《R代码TCGA数据差异表达分析》三部分内容。

1.第一期，讲解过滤重复样本，过滤样本类型函数
2.第二期，讲解三种差异表达方法limma，edgeR和DEseq2，以及差异表达分析结果过滤函数。会对差异表达基因做注释，将Ensembl基因ID转换成基因名字。添加基因的RNA类型(mRNA，lncRNA，pseudogene etc)，便于后续其他类型的分析(相关性分析，ceRNA分析 etc)。
3.第三期，采用TCGA真是数据，演示RNAseq数据及miRNA seq数据差异表达分析
4.第四期，windows下如何安装R和Rstudio软件
5.第五期，mac下如何安装R和Rstudio软件

用电脑打开腾讯课堂，课程资料在课程介绍的下方

内容版权声明：除非注明，否则皆为本站转载文章。文章及图片版权归原作者所有，如有侵权请联系我们，我们立刻删除。