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RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计、外泌体、表观遗传

2023-12-05 20:00课程 人已围观

课程安排: 会议日程 日期 时间 大纲 详细内容 周六上午(理论) 8:30-10:30 RNA甲基化功能机制 1.RNA甲基化研究概述 2.RNA甲基化类型、特征、生成和作用机制 3.RNA甲基化对RNA加工代谢的调控 4.RNA甲基化调控多种生物学功能的作用机理 10:45-12:00 RNA甲基化研究策略及思路分析 1.RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用 2.通过高分文献解读并总结RNA甲基化调控肿瘤研究思路   12:00-13:30 午餐及午休 周六下午(理论+实操) 13:30-15:30 RNA甲基化测序和数据分析(一) 1.RNA甲基化研究技术路线概览。 2.RNA甲基化常用的各种测序技术 3.m6A甲基化的研究思路和分析内容 4.m6A测序技术流程介绍及测序报告解读 15:45-18:00 RNA甲基化测序和数据分析(二) 5.m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展 6.m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析 (R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等   周日上午(理论) 8:30-10:30
  RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(一) 1.RNA甲基化与RNA甲基化蛋白功能网络研究 2.整合多组学探索RNA甲基化的功能和机制 3.RNA甲基化与RNA-seq、Ribosome profiling等数据整合分析 10:45-12:00
  RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(二) 4.非编码RNA(miRNA、circRNA及lncRNA等)的RNA甲基化分析思路 5.RNA甲基化研究策略、课题设计与经验交流 6.RNA甲基化相关国自然课题介绍   12:00-13:30 午餐及午休 周日下午(理论+实操) 13:30-15:30 利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(一) 1.通过TCGA,GEPIA,ENCORI等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路 2.通过RNA甲基化常用数据库(RMBase,m6AVar,MeT-DB,whistle)等明确关键基因的修饰位点 3.预测RNA甲基化位点在线工具介绍 4.RNA甲基化修饰基因功能富集分析(DAVID,Metascape等) 15:45-17:30 利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(二) 5.RNA甲基化研究常见图形绘制:分布趋势图,饼图,热图,韦恩图,火山图,散点图,GO、KEGG富集图,网络图,累积曲线图,GSEA图等 6.RNA甲基化基金申请写作思路、准备内容及方案设计注意事项等 7.讨论及个性化问题答疑 备注 上课使用软件为R和Rstudio

学习目标:
由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流程、方法和软件,国自然课题设计思路,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。

授课形式:
1、理论结合实操;
2、案例讲解分析结合;
3、协助分析学员的实际数据

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