TCGA数据库肿瘤突变负荷数据分析

适用人群

生物信息学学员，高校生物、计算机相关专业教师、学生，医学科研人员，医院从业人员，生物专业相关从业人员

课程概述

课程分四部分的内容：
第一部分：
TMB就是肿瘤组织每兆碱基中突变的总数。通俗的讲，就是肿瘤基因的突变密度，也就是肿瘤基因组中平均有多少突变，包括基因编码错误、碱基替换、基因插入和确实错误的总数。
一定程度上可以理解成单位区域内发生变换的密度总量越大，肿瘤突变负荷（TMB）越高，那么可能相应的肿瘤相关的致癌突变越多，每个肿瘤的个性就越突出，越不同于正常细胞。
肿瘤免疫治疗的精髓就是通过各种方法换气、加强机体的免疫系统对肿瘤的杀伤。这种情况下，肿瘤突变负荷（TMB）越大，即突变越大的癌细胞，越不像正常细胞，越容易被免疫细胞发现，越容易成为肿瘤免疫的靶子，从而理论上讲越有可能对免疫治疗有效。
TMB越高的肿瘤病人对于免疫反应的效果越好。
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突变数据常见图形
计算肿瘤突变负荷
第二部分：
TMB和生存关系
TMB和临床性状关系
第三部分：TMB和基因表达的关系
第四部分：突变和免疫浸润关系

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