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TCGA数据库ATAC
2023-12-04 21:57课程 人已围观
适用人群
生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员
课程概述
TCGA数据库ATAC-seq挖掘视频(染色质开放性/peak/motif/调控因子)本课程为连载课程,课程第一次发布4个课时,接下来每天更新5个课程,一共19个课程,将在发布后3天更新所有的课程内容
课程主要内容包括:
TCGA数据库ATAC-seq简介
ATAC数据下载
ATAC数据整理
覆盖度图
基因组特征图
Upset图绘制
TSS柱状图
绘制热图
TSS距离分布
GO富集分析
KEGG富集分析
bed转换为fasta
motif查找和注释
mRNA数据下载
mRNA数据合并
Ensembl转换为基因名
peak和mRNA矩阵合并
相关性分析
相关性结果注释
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
*学习课程评价课程后请联系 微信:18520221056,获得更多帮助。