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TCGA数据库肿瘤微环境视频(免疫细胞/基质细胞/ESTIMATE)
2023-12-04 21:57课程 人已围观
适用人群
生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员
课程概述
本课程为连载课程,一共23个课时,第一天发布4个课时,接下来每天4个课时更新。购买课程提供脚本、答疑、发票请联系微信:18520221056。我们是使用ESTIMATE预测软件,这个软件可以预测我们肿瘤的一个纯度,重要是通过预测免疫打分和基质打分预测肿瘤的纯度,从而预测基质细胞和免疫细胞的含量,预测到基质和免疫细胞的含量之后,基质细胞和免疫细胞含量多了,那么肿瘤纯度就低。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
首先会给大家介绍肿瘤的微环境,肿瘤微环境是肿瘤细胞所处的细胞环境,其组成包括细胞外基质、可溶性分子和肿瘤基质细胞。肿瘤微环境一旦形成,众多面会议细胞,如T细胞、髓源抑制细胞、巨噬细胞等,都被催化至此,构成肿瘤的微环境。
在肿瘤微环境中,免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分,并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估具有价值的。