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GROMACS专题五：粗粒化力场建立和模拟
2023-06-13 21:02课程 人已围观
【版本】
GROMACS V5.1.2
【课程简介】
粗粒化分子动力学(Coarse Grained Molecular Dynamics, CGMD)方法是近几年来发展起来的一种可以在介观尺度上描述分子体系演变过程的计算机模拟方法。相比于传统分子动力学模拟方法所能描述的尺度（纳秒，纳米），其最大特点是具有多尺度穿越性，即在有限的计算能力条件下，可以对大尺度（微秒、微米）的介观分子体系进行描述，同时保留指定分子的专一特性，这是传统分子动力学模拟无法做到的。
【课程目录】
第一节：溶液中的蛋白粗粒化模拟
第二节：小分子粗粒化构建
第三节：磷脂膜、混合膜粗粒化的构建和模拟
第四节：膜蛋白粗粒化的构建和模拟
第五节：DNA、RNA粗粒化的构建和模拟
第六节：VMD显示粗粒化结果
【适用人群】
1、GROMACS零基础
2、具备一定经验者
3、GROMACS爱好者
4、毕业设计需要
5、研究课题需要
【咨询】
获取GROMACS相关学习资料，了解最新信息，请添加官方qq群：709020941
GROMACS V5.1.2
【课程简介】
粗粒化分子动力学(Coarse Grained Molecular Dynamics, CGMD)方法是近几年来发展起来的一种可以在介观尺度上描述分子体系演变过程的计算机模拟方法。相比于传统分子动力学模拟方法所能描述的尺度（纳秒，纳米），其最大特点是具有多尺度穿越性，即在有限的计算能力条件下，可以对大尺度（微秒、微米）的介观分子体系进行描述，同时保留指定分子的专一特性，这是传统分子动力学模拟无法做到的。
【课程目录】
第一节：溶液中的蛋白粗粒化模拟
第二节：小分子粗粒化构建
第三节：磷脂膜、混合膜粗粒化的构建和模拟
第四节：膜蛋白粗粒化的构建和模拟
第五节：DNA、RNA粗粒化的构建和模拟
第六节：VMD显示粗粒化结果
【适用人群】
1、GROMACS零基础
2、具备一定经验者
3、GROMACS爱好者
4、毕业设计需要
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