Omicsmart微生物数据挖掘实战

基迪奥Omicsmart动态交互分析平台集测序数据上传、流程分析、数据挖掘、图形美化、SCI级图形下载于一体，已协作发表多篇微生物领域高分文章。

借助平台的时时交互展示，我们从NCBI获得文献对应的原始测序数据，为大家详细展示分享每篇文章“从测序数据到文章发表”整个过程的研究思路、处理技巧、分析策略，方便大家从已发表的文章中借鉴积累经验。

本系列课程由基迪奥金牌讲师小师兄、半夏、小鱼儿、阿拉雷主讲，课程将根据需要不时更新，目前主要内容如下：

  微生物多样性数据挖掘之原始数据分析课程主要介绍如何利用Omicsmart平台对原始数据进行分析，并结合Omicsmart平台进行操作，展示讲解数据分析图形；
 

 
α/β多样性分析理论与数据挖掘实战课程主要介绍α多样性、β多样性分析介绍，并结合Omicsmart平台，综合α多样性差异不显著和离群样本案例讲解α、β多样性数据挖掘；
 

 
物种分析理论与数据挖掘实战课程、功能分析理论与数据挖掘实战课程和环境因子关联分析理论与数据挖掘实战课程系统性的梳理微生物多样性分析相关的理论知识，同时汇总功能分析过程中可能遇到的疑问和难题，并为大家分享基于Omicsmart的详细有效的解决策略和方案；
 

 
主要对比介绍16S、18S和ITS，宏基因组物种注释和相关数据库，展示OmicShare绘图实操和在实际案例中的应用；结合经典案例介绍功能分析方法和相关数据库、分析思路等；主要结合Omicsmart简要介绍环境因子，并介绍CCA分析理论和数据挖掘要点，相关性网络图的绘制调整和其他拓展介绍；

  图表动态交互实现微生物数据挖掘课程主要通过动态交互图表的方式进行微生物的数据挖掘，并以实际数据案例演示如何使用动态交互图表进行微生物的数据挖掘，解决数据挖掘有难度、数据可视化效果不佳的问题；

 
微生物数据重复性差解决方案课程主要介绍生物学重复的基础理论、重复性不好的“表型”、解决方案；并结合案例和Omicsmart实操进行讲解；

  果蝇共生菌文章重现（α、β多样性分析）课程主要介绍基于完整的桔小实蝇文章案例，综合展示拿到微生物测序reads后进行数据分析的基本方向和分析细节；

珊瑚相关微生物文章重现（物种分析）：由物种分析基础知识，引入珊瑚礁微生物群落案例分析，介绍发文思路和基于Omicsmart对案例进行数据分析；

土壤微生物文章重现（环境因子关联分析）：主要以一篇土壤微生物文章作为案例，解析当前土壤微生物群落研究的分析思路，利用在线平台工具快速、高效重现文章中的数据挖掘工作；
以下展示课程视频的部分PPT内容：

 

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